FC Lokomotiv-Pamir dastlab 1961-yilda „Lokomotiv Dushanbe“ nomi ostida tashkil etilgan. 1990-yillarning boshlarida jamoa tarqatib yuborilganidan soʻng, klub 1999-yilning boshida qayta tiklangan va 2000-yil oxirida yana oʻz faoliyatini toʻxtatgan. Lokomotiv Dushanbe 2008-yilda yana qayta tashkil etilgan hamda 2017-yilda „Pamir“ jamoasi bilan birlashib, „Lokomotiv-Pamir“ nomini olgan.
Eslatma: Bayroqlar FIFA muvofiqlik qoidalariga koʻra belgilangan milliy terma jamoalarni ifodalaydi. Oʻyinchilar FIFAga aʼzo boʻlmagan bir nechta fuqarolikka ega boʻlishlari mumkin.